Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrx1Q3TL44 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms