Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdlim7Q3TJD7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms