Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VrtnQ3SYK4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms