Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.2 ms