Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAX3

Fads2p1, Fatty acid desaturase 2-like protein FADS2P1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fads2p1Q0VAX3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fads2p1Q0VAX3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fads2p1Q0VAX3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms