Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntnap5aQ0V8T9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5aQ0V8T9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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