Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms