Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPINDOCQ05AH6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPINDOCQ05AH6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms