Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms