Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax5Q02650 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.6 ms