Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms