Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Psme1P97371 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Psme1P97371 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Psme1P97371 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psme1P97371 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme1P97371 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme1P97371 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme1P97371 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms