Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RptnP97347 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RptnP97347 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RptnP97347 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RptnP97347 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RptnP97347 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RptnP97347 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RptnP97347 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RptnP97347 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RptnP97347 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RptnP97347 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RptnP97347 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RptnP97347 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RptnP97347 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RptnP97347 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RptnP97347 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RptnP97347 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RptnP97347 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RptnP97347 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RptnP97347 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms