Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Samsn1P57725 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms