Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Upp1P52624 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Upp1P52624 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Upp1P52624 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms