Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf1P46099 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf1P46099 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf1P46099 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf1P46099 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms