Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmx3P42581 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms