Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms