Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn11P35235 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms