Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rom1P32958 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1061.3 ms