Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kif3aP28741 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms