Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms