Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms