Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm3P21107 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms