Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpraP18052 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpraP18052 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpraP18052 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpraP18052 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpraP18052 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpraP18052 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpraP18052 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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