Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb2P0C1T1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms