Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hoxb5P09079 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxb5P09079 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxb5P09079 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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