Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01725 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01725 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P01725 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01725 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01725 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01725 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01725 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01725 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01725 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01725 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01725 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01725 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01725 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01725 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01725 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01725 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01725 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01725 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms