Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sypl2O89104 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms