Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2f6O54917 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2f6O54917 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms