Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chil3O35744 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chil3O35744 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chil3O35744 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms