Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad7O35253 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad7O35253 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad7O35253 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms