Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx2O08686 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx2O08686 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx2O08686 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms