Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna3O08545 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms