Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp955bL7N232 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp955bL7N232 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms