Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21900J3QP38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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