Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa8J3QNX5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa8J3QNX5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms