Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbip1J3QMK2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bbip1J3QMK2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms