Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lipo1J3QME6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lipo1J3QME6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms