Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r194J3JS27 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms