Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms