Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rfx7F8VPJ6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx7F8VPJ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms