Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5624F6ZZG8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5624F6ZZG8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5624F6ZZG8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms