Protein–RNA interactions for Protein: E9Q346

Vmn1r160, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r160E9Q346 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r160E9Q346 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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