Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r68E9Q0V3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms