Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610021A01RikE9Q0Q3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms