Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8127E9Q0P0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8127E9Q0P0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms