Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm13E9PZZ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm13E9PZZ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm13E9PZZ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm13E9PZZ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm13E9PZZ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm13E9PZZ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms