Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc78D3Z5T1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms