Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brpf1B2RRD7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms